2 - Prahování a ROI oblasti buněk s fenoly

Původní pravděpodobnostní mapu buněk s fenoly jsme naprahovali červeně tak, abychom vyznačili oblast buněk s fenoly (Image>Adjust>Threshold AUTO). Do červené oblasti jsme klikli kouzelnou hůlkou (magic wand v nástrojovém menu ImageJ). Vytvořil se malý částečný ROI. Abychom získali ROI celé oblasti, nastavili jsme výběr (Edit>Selection>Create Selection). Otevřeli jsme ROI manager (Analyze>Tools>ROI manager) a přidali do něj vyznačenou oblast (Add, možno udělat i klávesovou zkratkou t), kterou jsme vzápětí přejmenovali (Rename) "phenolics" .