O laboratoři

Naše laboratoř se zabývá studiem metabolismu a působení růstových regulátorů, polyaminů a fenolických látek v rostlinách. Věnujeme se otázkám úlohy těchto látek ve vývoji rostlin a v odpovědi na abiotický stres.
Používáme různé rostlinné modelové systémy - od celých rostlin až po buněčné kultury. Největší pozornost věnujeme procesu somatické embryogeneze jehličnanů; studujeme zákonitosti vývoje embryí, hormonální regulaci procesu somatické embryogeneze i vliv stresových faktorů na vývoj somatických embryí. Věnujeme se také množení medicinálního konopí in vitro. Studujeme především vliv fytohormonů (auxinů a cytokininů) přidaných do kultivačního média na proces organogeneze ze segmentů rostlin konopí vypěstovaných in vitro ze semen.
Využíváme široké spektrum metodických přístupů:

  • Mikroskopické metody – světelná transmisní, fluorescenční a  konfokální mikroskopie, s návazností na počítačovou analýzu obrazu

  • Biochemické metody – studium aktivity enzymů metabolismu biologicky aktivních látek (např. radiometrie)

  • Metody molekulární biologie - analýza exprese zájmových genů a transformace tkáňových kultur

  • Analytické metody – stanovení obsahu biologicky aktivních látek (HPLC, LCMS, GCMS), ve spolupráci s Laboratoří hormonálních regulací u rostlin ÚEB

Contrasting gene expression patterns during floral induction in two Chenopodium ficifolium genotypes reveal putative flowering regulators

Napsal uživatel Kateřina Eliášová dne Po, 07.04.2025 - 11:20

Chenopodium ficifolium is a close diploid relative of the tetraploid crop Chenopodium quinoa. Owing to its reproducible germination and seedling development, it becomes a promising model for studying floral induction, providing a basis for comparison with C. quinoa. Two C. ficifolium genotypes differ in photoperiodic requirement: C. ficifolium 283 accelerates flowering under long days, whereas C. ficifolium 459 flowers earlier under short days.

Response of mature somatic embryos of hybrid larch to cold and desiccation treatments

Napsal uživatel Kateřina Eliášová dne Po, 09.12.2024 - 14:29

Somatic embryogenesis of conifers yields somatic embryos (SEs) that closely resemble non-mature cotyledonary zygotic embryos (ZEs). The most common method to improve the biochemical composition of SEs and reduce their water content to bring SEs closer to fully mature ZEs is cold treatment or desiccation at different relative humidity (RH). Both treatments can not only lead to successful SE germination but can also induce a stress response.

The impact of the application of compochar on soil moisture, stress, yield and nutritional properties of legumes under drought stress

Napsal uživatel Kateřina Eliášová dne St, 06.03.2024 - 16:15

Nowadays, when climate change is becoming more and more evident, drought stress plays a very important role, including in agriculture. The increasing number of years with extreme temperatures in the Czech Republic has a negative impact on agricultural production, among other things. Therefore, ways are being sought to reduce these negative impacts. One of them may be the use of compochar (a mixture of compost and biochar) to improve water retention in the soil.

Interní autoři

Wholemount immunolabeling and stereological quantification of autophagosomes in Arabidopsis thaliana root epidermal cells

Napsal uživatel Kateřina Eliášová dne St, 06.03.2024 - 16:03

The workflow enables the quantification of autophagosomes in Arabidopsis thaliana root epidermal cells in 3D. It combines immunolabeling of an autophagosome marker ATG8 with commercially available anti-ATG antibody and the subsequent stereological quantification of the immunolabeled particles. The immunolabeled samples are imaged with a confocal microscope and Z-stacks are acquired.

Interní autoři

A novel workflow for unbiased quantification of autophagosomes in 3D in Arabidopsis thaliana roots

Napsal uživatel Kateřina Eliášová dne St, 06.03.2024 - 15:46

Macroautophagy is often quantified by live imaging of autophagosomes labeled with fluorescently tagged ATG8 protein (FP-ATG8) in Arabidopsis thaliana. The labeled particles are then counted in single focal planes. This approach may lead to inaccurate results as the actual 3D distribution of autophagosomes is not taken into account and appropriate sampling in the Z-direction is not performed.

Interní autoři